根据《规划》，泉州港由四大港区构成，分别是湄洲湾南岸港区、泉州湾港区、深沪湾港区和围头湾港区，其中湄洲湾南岸港区、泉州湾港区是泉州港的中心港区，肖厝、鲤鱼尾、石湖则是泉州港的核心作业区。每个港区都有其明确的功能：湄洲湾南岸港区开展大型散货、大型远洋集装箱运输及发展临港工业；泉州湾港区开展内外贸（以内贸为主）集装箱、多用途、通用、对台综合性的运输；围头湾港区和深沪湾港区开展服务于地方经济生产的多样性运输，包括集装箱、干散货、液散货、件散货，中远期可向大型化发展。

        据了解，湄洲湾南岸，水深，建港资源优越，将以石化船舶工业为主要发展方向。如福炼10万吨级原油码头、在建的30万吨原油码头等大型液散泊位、即将建成的1200万吨规模炼化一体化上下游系列企业以及泉州修造船厂等大型临海工业企业……这些大型临海工业项目的开发将奠定泉州港为福建省大型工业港。

        据预测，2010年，泉州港货物总吞吐量将达1.06亿吨，集装箱吞吐量为200万标箱；2020年，货物总吞吐量达2亿吨，集装箱吞吐量为800万标箱。