据海关统计，首季度深圳港进出口集装箱吞吐量达380万标箱，同比增长12.5%，其中进口178万标箱，增长9%，出口202万标箱，增长15.8%，稳居世界第四大集装箱港。其中盐田港集装箱吞吐量为183.2万标箱，增长11.8%，单港吞吐量继续居全国首位。

        以深圳盐田港为例，港区投入运作的泊位共11个，在建的三期集装箱码头扩建工程建成后，年吞吐能力将再增加370万标箱。同时，盐田国际码头岸吊操作效率达到35吊次/小时，平均船舶操作效率达到150吊次/小时，达到世界先进水平，吸引世界排名前20位的船务公司在深圳设立办事处，并已形成覆盖世界十二大航区主要港口的国际班轮网络。

        此外，据企业统计，国家在深圳试行「入仓即予退税」新政策后，出口企业资金周转利用率提高了15%以上，提高了出口企业的积极性。2006年开始实施的《海关对出口监管仓库及所存货物的管理办法》允许出口监管仓开展流通性增值业务，更有力促进港口物流业及配套产业的发展。

        同时，深圳海关推进了海运通关模式改革，实行智能化集中查验。目前，该关已在盐田港区建立封闭式查验中心，蛇口港区前海湾集中查验中心正在抓紧建设中。新的海运集中查验模式使监管效能得到明显提升，查验能力由120柜/天增至500柜/天，查验当天放行率达92.8%，降低了企业通关成本。